福建省厦门实验小学的前身是爱国华侨领袖陈嘉庚先生倡办的国立第一侨民师范学校附属小学。1944年创办于长汀，1946年2月迁回厦门， 1949年11月12日由厦门市人民政府接管，命名为厦门实验小学。1952年，厦门市人民政府梁灵光市长亲自选址于市同安里5号建新校舍。"文革"前17年，厦门实验小学在党和政府领导下，坚持全面贯彻教育方针，努力进行各项教育教学改革，建设了一支素质优良的教师队伍，形成了"尊师学好，爱生教好"的优良校风，成为福建省著名的重点小学。1960年被评为福建省全面贯彻教育方针红旗单位。1967年，更名为卫东小学，1973年育红小学并入，1978年恢复实验小学校名。
　　1979年，厦门实小被省教育厅确定为福建省首批办好的重点小学之一。从此，学校走上了振兴发展的道路。特别是1981年厦门建立经济特区以来，学校努力探索科学育人新路，着力推进应试教育向素质教育转轨，提高学生的全面素质，并以"策略教育"科研实验为龙头，指导和推动各科教学改革，大大提高了课堂教学效率，发展了学生的个性和特长，取得了丰硕的成果。一支教风严谨，锐意创新的教师队伍也在教改实践中成长起来。1999年，我校大胆进行课程计划改革试验，将思品、劳动、社会课合并，开设"社会生活实践综合活动课"，受到学生欢迎。2001年秋季，我们承担了国家课改基地实验校的任务，大力实施课程改革，转变教师教育思想，树立新的教学理念，改革教学管理、教学方法和评价方式，一系列的改革，激活了教学，激活了校园，促进了师生的共同发展。
　　1998年，学校完成了新校舍首期改扩建工程，校园达到绿化、美化、场室标准化、设备现代化的要求。　　2004年，学校进行教学楼二期工程改扩建，现校园占地面积16165平方米,建筑面积12064平方米，每间教室都配有电视机、电脑、实物展台、液晶投影仪等多媒体教学设备，音乐、美术、自然实验、信息技术等专用场室和图书馆、体操房、多功能教室俱全。学校建立学籍、图书、档案、财务、人事等计算机管理系统，建立了校园网，为师生创设一个现代化、信息化的优良环境。